2008年度中央预算执行和其他财政收支的审计情况表明，一些地区或部门经费投入保障管理责任未完全落实到位，造成基础教育经费管理使用、招生和收费政策执行等方面还存在一些问题。
　　　　审计署审计长刘家义说，2006年至2007年，一些教育部门和学校违规收取择校、补课、赞助等费用5.02亿元，部分城市违规统筹使用、挤占挪用基础教育经费18.08亿元，一些地区和部门滞留基础教育经费24.31亿元。
　　　　审计中还发现部分学校大量举债。刘家义说，抽查的17所示范中学2008年9月底债务余额共计20.81亿元，平均每所学校负债1.22亿元，借入的资金主要用于校区建设。